Le pipeline PIANO™ entièrement automatisé développé par Biospective a été utilisé à la fois pour l’analyse voxellogique exploratoire et l’analyse quantitative du volume régional, afin d’étudier les variantes de FTD et les populations témoins saines.
Cette illustration donne un aperçu général des différentes étapes de PIANO,™ notre « pipeline » automatisé de traitement structurel par IRM. PIANO™ est un système configurable, modulaire et basé sur des pipelines pour le traitement entièrement automatisé d’images multimodales. PIANO™ est conçu pour le traitement à haut débit de données de neuroimagerie multicentriques à grande échelle. Brièvement des examens IRM 3D pondérés en T1 ont été effectués :
- Correction de la non-uniformité de l’image à l’aide de l’algorithme N3, masquage cérébral et transformation spatiale linéaire en « espace stéréotaxique ».
- Morphométrie exploratoire basée sur la déformation voxélienne (DBM) générée à partir des champs de déformation non linéaires associés aux transformations spatiales.
- Les volumes stéréotaxiques ont été segmentés en matière grise (GM), substance blanche (WM) et liquide céphalo-rachidien (LCR) à l’aide d’un modèle d’apprentissage profond formé en interne.
- L’analyse voxelique de la densité de la matière grise a été dérivée des images normalisées pondérées T1 sous-jacentes en combinaison avec la classification des tissus.
- Une morphométrie régionale basée sur le volume a ensuite été réalisée sur des ROI prédéfinis. Des zones d’intérêt spécifiques ont été définies anatomiquement, explicitement sur un modèle ou générées implicitement à l’aide d’un modèle d’apprentissage profond (hippocampe), et ont été combinées avec une classification tissulaire spécifique au sujet, au besoin.