L'analyse entièrement automatisé (PIANO™) de la morphologie vertex par vertex des structures sous-corticales a été utilisé pour étudier les populations, prodromales et témoins. Les images anatomiques enregistrées peuvent être utilisées pour extraire la surface externe des structures sous-corticales et calculer vertex par vertex les déformations non linéaires le long de la surface normale.
Cette illustration offre un aperçu général des différentes étapes impliquées dans PIANO™, notre « pipeline » automatisé de traitement d'IRM structurelle. PIANO™ est un système modulaire, configurable et basé sur un pipeline pour le traitement entièrement automatisé d’images multimodales. PIANO™ est conçu pour le traitement à haut débit de données de neuroimagerie multicentriques à grande échelle. En résumé, les IRM 3DT1 ont été soumis aux étapes suivantes :
- Correction de non-uniformité d’image utilisant l’algorithme N3, masquage cérébral, transformation spatiale linéaire vers « l'espace stéréotaxique », et transformation non linéaire vers un « espace modèle » prédéfini.
- Calcul des champs de déformation non linéaires associés à la transformation spatiale vers l’espace de gabarit.
- Les volumes spécifiques d’intérêts (VOI) étaient définis anatomiquement, explicitement sur un modèle, ou générés implicitement à l’aide d’un modèle d’apprentissage profond, et combinés avec une classification tissulaire spécifique au sujet selon les besoins.
- Les surfaces extérieures des différents VOI, y compris le thalamus, l’hippocampe, le noyau caudé, le putamen et le mésencéphale, ont été automatiquement extraites à l’aide de l’algorithme «Marching Cubes».
- La déformation locale sur les surfaces était quantifiée par la projection de la transformation non linéaire du modèle vers le sujet sur le vecteur normal à la surface du modèle.
- L’analyse de forme par sommet des VOIs sous-corticaux a été dérivée des cartes de déformation sous-jacentes le long des surfaces externes normales.